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基金缺乏创新被毙,来几条m6A思路洗洗脑

师兄 小张聊科研 2019-06-30

虽然国自然尚未放榜,但是有不少人已经提前知道了结果,根据往年的统计数字国自然中标的比例大概在20%左右,有些人早就知道连网评都没通过,也许还不是最郁闷的,有一部分呢则是上会了但是最终还是被毙,这应该是最郁闷,明明就差那么一点,为啥自己就成了20%里的分母了,别人却成功上岸,成了分子。

被毙的因素有很多,专家真要挑毛病,谁都不是100%完美的,其中有一个因素非常关键,那就是创新性!相比青年基金,地区基金、面上项目,要求更高竞争也更激烈,因为可能需要和许多本领域的大牛竞争,而作为科研菜鸟,基础是没法和大牛比的,那么,国青就是一个可以拼一拼创新能力的领域了,但是,但是对年龄又有要求,所以寻找好的idea来申请青年基金便必不可少了,何来创新的idea?

咱们今天来讲一讲RNA甲基化这个热点(仅供需要的小伙伴参考,看不上的请自动绕道),有多热?一个月就能发掉10多篇10分+的文章,但是国自然中的RNA甲基化的项目却不多,区区10多项。

2017 m6A的国自然项目

生物钟基因BMAL1在人类胚胎干细胞分化中的作用及其mRNA甲基化的调控

piRNA调节m6A RNA甲基化参与MM发生发展的机制研究

RNA甲基化酶METTL14介导的lncRNA-m6A修饰在肝癌干细胞中的作用及机制研究

CDCP1 m6A RNA甲基化调控在膀胱癌发生发展中的作用及其机制

RNA甲基化m6A修饰位点变异与先天性心脏病遗传易感机制研究

m6A甲基化作用下的circHOOK3/miR558/ TGFβR1调控轴影响神经母细胞瘤发生、发展的作用机制

N6-Methyladenosine (m6A) 表观遗传修饰酶METTL3对食管癌的调控及机理研究

m6A甲基转移酶METTL3促进结直肠癌增殖转移的分子机制研究

香烟凝集物通过RNA-m6a甲基化修饰调控miRNA-25成熟在胰腺癌致病机制中的作用

TARBP2和m6A依赖的外泌体miRNAs筛选、鉴定及作为肝癌转移标志物的评价

国自然所有的RNA甲基化的项目,m6A研究方向有干细胞分化、piRNA、lncRNA、易感基因、circRNA、肿瘤、miRNA的甲基化、外泌体miRNA等,可谓都是非常吸引人的项目,满打满算,现在收集一些样本或者细胞做一点RNA甲基化测序,得到一些有意思的分子,然后设计课题思路,那么思路的话,咱们就来看看几篇m6A最新综述文章了。

(1)N6-methyladenosine links RNA metabolism to cancer progression

杂志:Cell Death & Disease

影响因子:5.6分

时间:2018年6月

m6A参与了RNA代谢的全过程

RNA甲基化 (m6A)是mRNA最常见的修饰形式,而m6A和RNA的代谢过程密切相关,这包括mRNA的加工、从细胞核到细胞质的mRNA输出、mRNA翻译、mRNA衰变,另外甚至调控着长链非编码RNA(lncRNA)和microRNA的生物发生。最近越来越多的研究有发现m6A与癌症相关,例如有助于肿瘤干细胞的自我更新,促进癌细胞的生长、增殖,抗放疗或化疗,m6A相关的蛋白质被阻断后,被鉴定有抑制癌症的作用,表明m6A可能是癌症的靶点治疗,本文就m6A在人类癌变过程中的调控作用进行综述。

那么RNA甲基化相关的三种类的蛋白酶都有哪些呢?小编给大家进行了总结,由RNA甲基转移酶复合体(METTL3、METTL14和WTAP等)、去甲基酶(FTO和ALKBH5等)以及相应的阅读器(YTHDF1/2/3,YTHDC1等)协同调控。

m6A修饰相关的“writers”、“readers”和“erasers”


他们这些蛋白与干细胞分化、肺癌、肝癌、骨肉瘤、白血病、神经母细胞瘤、乳腺癌等癌症的发生发展有大量的文献报道。

 

(2)m6A RNA Methylation Controls Neural Development and Is Involved

in Human Diseases

杂志:Molecular Neurobiology

影响因子:5分

时间:2018年6月

该文除了对m6A的基本概念介绍以外,主要对m6A对于神经发育调控以及其他疾病的研究做了深入的研究,首先我们需要知道哪些基因m6A甲基化了,那么我们就需要用到MeDIP-seq技术,这个价格也是不菲的。

 

m6A在拟南芥、斑马鱼的胚胎发育被证明存在调控作用,那么在动物中也是类似的,除了肿瘤有关,m6A在阿尔兹海默、神经元的发育等神经系统的疾病发生发展中也存在重要作用。

 

(3)Multiple functions of m6A RNA methylation in cancer

 杂志: Journal of Hematology & Oncology

影响因子:7.3分

时间:2018年8月

 

改综述只是对m6A在肿瘤中的调控机制进行了概括,这些大家自己看下,作者最后提出了课题设计时大家需要注意的几点m6A的研究难点。

①m6A相关蛋白酶在肿瘤发生发展中到底起到抑癌还是促癌的作用?还是根本不起作用?

有一个研究指出METTL3即便是失活的状态也能起到促进翻译,有可能METTL3根本不是以m6A的修饰通路来调控的。另外SAM促进了甲基转移,最后的结果是肿瘤被抑制了,但是分子机制尚未得到完全的阐明。

 

②我们还需要确认m6A的详细分子机制,这非常有挑战。除了上述一些简单的蛋白酶催化外,还有可能miRNA和lncRNA参与了m6A的位点调控,有研究表明miRNA和anti-sense的lncRNA通过序列互补特性,对mRNA的m6A位点进行选择性调控。


③一条mRNA上面不同位点被m6A修饰后,可能会产生完全相反的效果。而甲基转移酶家族是如何识别这些位点并进行修饰的,这种机制目前研究的非常少,是非编码RNA在序列选择上给予了引导?这个是个非常有趣的问题.

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